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上述性能评价方法主要是针对CPU（有时包括内存），但没有考虑诸如I/O结构、操作系统、编译程序的效率等对系统性能的影响，因此难以准确评价计算机的实际工作能力。
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基准程序法（benchmark）是目前测试性能的较好方法，有多种多样的基准程序，如主要测试整数性能的基准程序逻辑、测试浮点性能的基准程序等。
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（1）Khrystone基准程序。Khrystone是一个综合性的整数基准测试程序，它是为了测试编译器和CPU处理整数指令和控制功能的有效性，人为地选择一些典型指令综合起来形成的测试程序。Khrystone基准程序用100条C语言语句编写而成，这种基准程序当今很少使用。
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（2）Linpack基准程序。Linpack基准程序是一个用Fortran语言写成的子程序软件包，称为基本线性代数子程序包，此程序完成的主要操作是浮点加法和浮点乘法操作。测量计算机系统的Linpack性能时，让机器运行Linpack程序，测量运行时间，将结果用MFLOPS表示。
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（3）Whetstone基准程序。Whetstone是用Fortran语言编写的综合性测试程序，主要由执行浮点运算、功能调用、数组变址、条件转移和超越函数的程序组成。Whetstone的测试结果用Kwips表示，1 Kwips表示机器每秒钟能执行1000条Whetstone指令。这种基准程序当今已很少使用。
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（4）SPEC（System Peformance Evaluation Cooperative，系统性能评估机构）基准程序。SPEC对计算机性能的测试有两种方法：一种是测试计算机完成单个任务有多快，称为速度测试；另一种是测试计算机在一定时间内能完成多少个任务，称为吞吐率测试。SPEC的两种测试方法又分为基本的和非基本的两类。基本的是指在编译程序的过程中严格限制所用的优化选项；非基本的是可以使用不同的编译器和编译选项以得到最好地性能，这就使得测试结果的可比性降低。SPEC CPU2000基准程序测试了CPU、存储器系统和编译器的性能。SPEC基准程序测试结果一般以SPECmark（SPEC分数）、SPECint（SPEC整数）和SPECfp（SPEC浮点数）来表示。其中SPEC分数是10个程序的几何平均值。
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（5）TPC（Transaction Processing Council，事务处理委员会）基准程序。TPC用来评测计算机在事务处理、数据库处理、企业管理与决策支持系统等方面的性能。该基准程序的评测结果用每秒完成的事务处理数TPC来表示。TPC-A基准程序规范用于评价在联机事务处理（OLTP）环境下的数据库和硬件的性能，不同系统之间用性能价格比进行比较；TPC-B测试的是不包括网络的纯事务处理量，用于模拟企业计算环境；TPC-C测试的是联机订货系统；TPC-D、TPC-H和TPC-R测试的都是决策支持系统；TPC-W是基于Web商业的测试标准，用来表示一些通过Internet进行市场服务和销售的商业行为，所以TPC-W可以看作是一个服务器的测试标准。
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