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信息应用系统验收需由建设单位组织，监理辅助和承建单位配合。建设单位的工作主要是审核承建单位的验收方案并确定验收方案，承建单位的工作主要是内部测试准备、验收准备工作、验收申请提交和验收方案准备。监理的工作重点是软件配置审核和验收测试，具体分为文档审核、源代码审核、配置脚本审核、测试程序或脚本审核和可执行程序测试。
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信息应用系统验收的过程与信息网络系统的验收过程是一致的，其基本步骤为提出验收申请、制订验收计划、成立验收委员会、进行验收测试和配置审计、进行验收评审、形成验收报告并移交产品。验收的地点及条件要符合合同或验收方案的规定。
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在信息应用系统验收阶段，验收委员会人数为不少于5人的单数，验收委员会的任务及其权限如下。
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（4）组织验收测试和配置审核，进行验收评审，并形成验收报告。
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（1）验收测试和配置审核是验收评审前必须完成的两项主要检查工作，由验收委员会主持。
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（2）测试组在认真审查需求规格说明、确认测试和系统测试的计划与分析结论的基础上制订验收测试计划。
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（3）配置审核组在需求规格说明、确认测试和系统测试等过程中形成的产品的变更管理及审核工作的基础上开展审计。
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（4）原有测试和审核结果凡可用的就可用，不必重做该项测试或审核。同时，可根据建设单位的要求临时增加一些测试和审核内容。
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（5）测试组在完成测试验收的同时，完成功能配置审核，即验证软件功能和接口与“合同”的一致性。
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（6）配置审核组完成物理配置审核，检查程序和文档的一致性、文档和文档的一致性、交付的产品与“合同”要求的一致性及符合有关标准的情况。
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（1）软件产品符合“合同”或“验收标准”规定的全部功能和质量要求。
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（2）不同安全性关键等级的软件均通过了《软件测试细则》文档要求的各项测试。
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（3）文档齐全，符合“合同”或“验收标准”的要求及有关标准的规定。
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（5）对被验收软件的可执行代码，在验收测试中查出的错误总数，以及错误严重性不超过建设单位事先约定的限制值。
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（6）配置审核时查出的交付文档中的错误总数不超过建设单位事先约定的限制值。
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验收报告的主要内容包括验收的各项内容、评价与验收结论、验收委员会全体成员签字及验收委员会主任的意见。
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如果验收未通过，则需要重新验收或进入合同争议。如果验收通过，则监理需要审查承建单位的项目资料清单、协助建设单位和承建单位交接项目资料、确保软件文档和软件的一致性，同时将开发软件做好备份，保管在安全的地方，文件材料归档。
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