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信息系统是作为统一整体而存在的。因此，在系统设计中，要从整个系统的角度进行考虑。比如，系统的代码要统一、设计规范要标准；传递语言要尽可能一致；对系统的数据采集要做到数出一处，全局共享，使一次输入得到多次利用等。
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在系统达到预定目标的情况下，应该尽量简单，避免一切不必要的设计。因此在设计过程中，要尽量使输入数据的形式容易理解和掌握，使数据处理过程简化，力求系统结构清晰、合理、保证使用者操作方便，修改容易等。
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为保持系统的长久生命力，要求系统具有很强的环境适应性。为此，系统应具有较好的开放性和结构的可变性。在系统设计中，应尽量采用模块化结构，提高各模块的独立性，尽可能减少模块间的数据耦合，是各子系统间的数据依赖降至最低限度。这样，既便于模块的修改，又便于增加新的内容，提高系统适应环境变化的能力。
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一个信息系统是否能发挥作用和具有较强的生命力，很大程度上取决于管理是否可接受。这要受业务管理水平、人员素质、传统思想等多方面因素的影响。
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系统设计还应该遵循经济性、安全性的原则。不同类型的信息系统的设计原则应该有所侧重。比如办公自动化系统应该强调可靠性和安全性的原则。对于一个服务性质的公众服务系统又应该强调系统的简单易用原则。
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